Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms