Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms