Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trim37Q6PCX9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim37Q6PCX9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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