Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp49Q6P9L4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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