Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Smchd1Q6P5D8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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