Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms