Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9aQ68FE2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms