Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PatjQ63ZW7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms