Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rbbp4Q60972 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms