Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot7Q60809 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cnot7Q60809 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms