Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdkn2dQ60773 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2dQ60773 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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