Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atf3Q60765 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms