Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms