Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Sft2d1Q5SSN7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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