Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r223Q5SSA0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r223Q5SSA0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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