Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms