Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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