Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Obox3Q3UT54 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Obox3Q3UT54 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox3Q3UT54 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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