Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms