Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms