Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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