Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms