Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms