Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MestQ07646 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.5 ms