Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms