Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Siah2Q06986 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms