Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms