Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms