Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms