Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
GscQ02591 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
GscQ02591 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
GscQ02591 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms