Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ascl1Q02067 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms