Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms