Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms