Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms