Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme1P97371 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms