Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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