Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms