Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tp53bp1P70399 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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