Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gfi1P70338 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms