Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms