Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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UbdP63072 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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