Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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