Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms