Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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