Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms