Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Aqp4P55088 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Aqp4P55088 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Aqp4P55088 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Aqp4P55088 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms