Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtpreP49446 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtpreP49446 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtpreP49446 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtpreP49446 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtpreP49446 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtpreP49446 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms