Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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