Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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