Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ThpoP40226 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms